Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gapvd1Q6PAR5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms