Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prkab2Q6PAM0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms