Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl2Q6PA06 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms