Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms