Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc148Q6P5U8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms