Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Fam222bQ6P539 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Fam222bQ6P539 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Fam222bQ6P539 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms