Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms