Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR2

Msantd2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd2Q6NZR2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msantd2Q6NZR2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msantd2Q6NZR2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msantd2Q6NZR2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms