Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pprc1Q6NZN1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pprc1Q6NZN1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms