Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Soga3Q6NZL0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms