Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Colgalt2Q6NVG7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms