Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms