Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxo41Q6NS60 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms