Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAQ7

Zzz3, ZZ-type zinc finger-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzz3Q6KAQ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zzz3Q6KAQ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zzz3Q6KAQ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms