Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms