Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Carmil1Q6EDY6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms