Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms