Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms