Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms