Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Thsd7aQ69ZU6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms