Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms