Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno1Q689Z5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sbno1Q689Z5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbno1Q689Z5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms