Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpgs2Q66JT5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms