Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn1Q64347 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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Clcn1Q64347 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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Clcn1Q64347 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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Clcn1Q64347 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
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Clcn1Q64347 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn1Q64347 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
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