Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms