Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc18Q640L5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
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