Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa13Q62424 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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