Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn1Q62261 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms