Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpaQ62189 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpaQ62189 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms