Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim27Q62158 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms