Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf1Q61999 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms