Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg2Q61878 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prg2Q61878 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms