Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrxQ61687 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrxQ61687 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms