Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms