Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms