Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms