Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms