Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms