Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbibQ60778 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms