Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atf3Q60765 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms