Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CttnQ60598 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms