Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sin3aQ60520 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sin3aQ60520 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms