Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf123Q5XPI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms