Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd5Q5VCS6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms