Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms