Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms