Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms