Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme4Q5SSW2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms