Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46cQ5SSF7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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