Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms